超微粉是藥品提高藥效的基礎，微粉化可提高藥物的生物利用度，降低用藥量，中藥的超微粉碎當前主要指細胞超微粉碎。動植物等藥材的主要藥效成分，通常分布于細胞內與細胞間，當細胞破壁后，其細胞內有效成分暴露出來，所以藥效大幅度提高，而且起效速度快。
細胞級破壁超微粉碎機是利用高頻振動及工作元件撞擊研磨原理來實現的。藥材在加工過程中相互碰撞、相互磨擦，瞬間破裂實現超微粉碎，因此，非常適用于中藥、西藥、保健品等物料的超微粉碎。

若將藥材使用中藥粉碎機經過細胞級微粉碎后，其有效成分被人體吸收則較為簡單。藥物進入胃中，可溶性成分在胃液作用下即溶解，進入小腸后溶解的成分開始被吸收。由于藥物為超細粒子，其不溶性成分也極易附著在腸壁上，藥物成分會快速通過腸壁吸收，進入血液，而且這些超微粒子因附著力強，排出體外所需時間較長，提高了藥物的吸收率。此外藥物成分從細胞內向細胞外遷移的過程所需時間縮短，不但吸收速度會明顯加快，而且吸收量也會大增加。

礦物類藥材，相當一部分為水溶性物質，其細度越高利用度亦越高。這與一些難溶性化學藥物的處理思路相同。通過提高藥物細度增大其比率表面積，則可改善體內吸收量及速度。

中藥超微粉碎機的細胞級微粉碎其混合均質也會提高。藥材粉碎混合均勻度（也稱為均質化）應以細度為基礎，粒度越細，其均勻度越高。但由于靜電及吸附作用，一般物料越細，其均質化越為困難。這是由于中藥一般含率均為6%以上，且有的又含有一定油性及揮發性成分，屬兩種極性物質的混合。在中藥粉碎機的細胞破壁粉碎過程中，通過高強度剪切力使其均勻混合，可過到液相混合及乳化的效果。實際上在混合粉碎過程中，由于細胞內水分的影響，物料的表面會呈半濕潤狀態，其粒子與粒子之間結合較為牢固，具有相當的穩定性。其油性及揮發性成分在混合粉碎的同時吸附在一些固體及半液態成分的表面，通過藥材中某些具有表面活性的物質使其易于同親水性成分相親和，達到均質的目的。若將其放入水中攪拌，也不會產生油性與水性成分之間的偏析。由于中藥超微粉碎機的細胞級微粉碎，會將藥材中的油細胞打破的同時進行均質，使得含有揮發性成分的復方中藥由于條件的不同而產生揮發性降低或提高的現象。經過均質復方中藥，其油性及揮發性成分可以在進入胃中很快分散均勻，因藥物均質的作用在小腸中會均勻的同其他水溶性成分同步吸收。這與用常規粉碎方式粉碎的未破壁藥材的吸收速度大相徑庭。